碳水化合物经常弥补定制研究饮食的大多数（重量和％KCAL），除了脂肪饮食更高。常用的碳水化合物来源包括蔗糖，玉米淀粉和麦芽糖糊精。其他来源包括果糖，葡萄糖（葡萄糖），糊精和乳糖。麦芽糖糊精酶促衍生自玉米淀粉，具有较短的葡萄糖聚合物，有助于蠕动的高脂肪饮食和玉米淀粉超过蔗糖的饮食。

蔗糖是大多数公式的一部分，通常占饮食的10％以上。这可能增加了饮食的适口性。可以操纵饮食的碳水化合物剖面，尽管一些混合物可能不会沉淀。还有非常小的碳水化合物的饮食，因此含有大量的脂肪和/或蛋白质。

纤维素（纤维）是许多配方的一部分，而啮齿动物不需要，则被认为是有益的。它也可用于制作具有不同Macronurient型材的公式。